二期总建筑面积：84958.99㎡，其中地上面积51499.36㎡，地下建筑面积33459.63㎡。主要由住院大楼、科研教学中心、地下室、液氧站等构成。 住院大楼地上6层，地上建筑面积约23949.47㎡，建筑高度30m，建筑消防高度26.80m。主要功能为静配中心、出入院办理、住院药房、日间化疗中心、PICC、诊室、超声检查、标准病房单元、手术中心等相关功能。 科研教学中心地上6层，地上建筑面积约27449.85㎡，建筑高度30m，建筑消防高度26.80m。主要为入口大厅、学术报告厅、医疗中心文化展厅、临床教学培训基地及临床考试中心（OSCE）、PCR实验室、公共实验平台、临床研究中心、大数据研究中心和人工智能研究院、院企合作平台等相关功能。 地下室地下2层，建筑高度9.9m，地下建筑面积约33459.63㎡。主要功能为生物样板库、车库、设备用房、人防工程等功能。 液氧站地上1层，建筑面积约100.04㎡，建筑高度5.40m，建筑消防高度5.10m。
